Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cers3Q1A3B0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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