Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ubxn2bQ0KL01 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms