Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Thbs3Q05895 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Thbs3Q05895 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Thbs3Q05895 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Thbs3Q05895 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Thbs3Q05895 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Thbs3Q05895 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Thbs3Q05895 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Thbs3Q05895 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Thbs3Q05895 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Thbs3Q05895 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms