Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sec23aQ01405 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sec23aQ01405 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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