Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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SeleQ00690 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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SeleQ00690 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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SeleQ00690 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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SeleQ00690 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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SeleQ00690 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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SeleQ00690 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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SeleQ00690 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SeleQ00690 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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SeleQ00690 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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SeleQ00690 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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SeleQ00690 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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SeleQ00690 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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SeleQ00690 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SeleQ00690 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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SeleQ00690 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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