Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Scn1bP97952 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms