Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H3f3aP84244 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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