Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Arf1P84078 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms