Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms