Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms