Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn18P56857 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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