Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
FmodP50608 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
FmodP50608 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
FmodP50608 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
FmodP50608 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
FmodP50608 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
FmodP50608 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
FmodP50608 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
FmodP50608 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FmodP50608 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FmodP50608 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms