Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rab11bP46638 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms