Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TfamP40630 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TfamP40630 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TfamP40630 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms