Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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