Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Hoxd10P28359 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Hoxd10P28359 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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