Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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