Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PdgfraP26618 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PdgfraP26618 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PdgfraP26618 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PdgfraP26618 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PdgfraP26618 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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PdgfraP26618 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PdgfraP26618 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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