Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fcer1aP20489 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms