Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P20040 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms