Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NelfeP19426 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms