Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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