Protein–RNA interactions for Protein: P16372

Zfp58, Zinc finger protein 58, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp58P16372 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Zfp58P16372 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Zfp58P16372 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Zfp58P16372 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zfp58P16372 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms