Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RhoP15409 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
RhoP15409 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RhoP15409 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RhoP15409 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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RhoP15409 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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RhoP15409 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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RhoP15409 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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RhoP15409 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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RhoP15409 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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RhoP15409 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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RhoP15409 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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RhoP15409 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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RhoP15409 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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RhoP15409 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RhoP15409 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RhoP15409 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms