Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Vpreb2P13373 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms