Protein–RNA interactions for Protein: P01804

Ig heavy chain V-III region HPC76 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01804 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01804 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01804 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01804 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms