Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ccl20O89093 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Ccl20O89093 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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