Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Vamp4O70480 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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