Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hps1O08983 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hps1O08983 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hps1O08983 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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