Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Mesp2O08574 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms