Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC154461.2-201ENSMUST00000225462 1980 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Dppa1-201ENSMUST00000077173 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Wdr61-202ENSMUST00000118771 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Gm21887J3QQ04 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Sec61g-201ENSMUST00000109641 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm9392-201ENSMUST00000119337 554 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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