Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem200cJ3QK46 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms