Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21818J3KMS6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Gm21818J3KMS6 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm21818J3KMS6 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm21818J3KMS6 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm21818J3KMS6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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