Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rarres1F6ZIS7 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms