Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm8005F6YKY3 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms