Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myo5cE9Q1F5 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms