Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc1E9Q043 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms