Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms