Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clrn2B2RVW2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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