Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ssxb8B1AY40 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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