Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spocd1B1ASB6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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