Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cldn34c4A2ANA3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms