Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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