Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gpc1Q9QZF2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
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Gpc1Q9QZF2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gpc1Q9QZF2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gpc1Q9QZF2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gpc1Q9QZF2 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gpc1Q9QZF2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Gpc1Q9QZF2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpc1Q9QZF2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpc1Q9QZF2 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpc1Q9QZF2 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpc1Q9QZF2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpc1Q9QZF2 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpc1Q9QZF2 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpc1Q9QZF2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpc1Q9QZF2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpc1Q9QZF2 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpc1Q9QZF2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gpc1Q9QZF2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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