Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
OtofQ9ESF1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
OtofQ9ESF1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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