Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms