Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm11191-201ENSMUST00000117231 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Scn4aQ9ER60 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scn4aQ9ER60 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scn4aQ9ER60 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms