Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Stx12Q9ER00 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms