Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms