Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf6Q9DBU5 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rnf6Q9DBU5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf6Q9DBU5 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rnf6Q9DBU5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Rnf6Q9DBU5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf6Q9DBU5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Rnf6Q9DBU5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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